MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	512443504
2	NC_021508	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	512443504
3	NC_021508	C	6	6	280	285	0 %	0 %	0 %	100 %	512443504
4	NC_021508	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	512443504
5	NC_021508	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
6	NC_021508	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443504
7	NC_021508	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443504
8	NC_021508	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	512443504
9	NC_021508	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443504
10	NC_021508	A	9	9	628	636	100 %	0 %	0 %	0 %	512443504
11	NC_021508	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
12	NC_021508	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	512443504
13	NC_021508	T	7	7	678	684	0 %	100 %	0 %	0 %	512443504
14	NC_021508	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443504
15	NC_021508	A	9	9	742	750	100 %	0 %	0 %	0 %	512443504
16	NC_021508	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
17	NC_021508	A	7	7	886	892	100 %	0 %	0 %	0 %	512443504
18	NC_021508	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443504
19	NC_021508	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
20	NC_021508	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	512443504
21	NC_021508	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
22	NC_021508	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
23	NC_021508	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
24	NC_021508	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
25	NC_021508	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443504
26	NC_021508	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
27	NC_021508	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443504
28	NC_021508	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443504
29	NC_021508	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	512443504
30	NC_021508	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	512443504
31	NC_021508	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021508	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021508	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021508	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021508	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021508	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021508	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021508	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021508	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021508	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021508	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
42	NC_021508	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	512443505
43	NC_021508	A	8	8	1710	1717	100 %	0 %	0 %	0 %	512443505
44	NC_021508	T	6	6	1726	1731	0 %	100 %	0 %	0 %	512443505
45	NC_021508	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443505
46	NC_021508	T	6	6	1846	1851	0 %	100 %	0 %	0 %	512443505
47	NC_021508	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443505
48	NC_021508	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443505
49	NC_021508	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
50	NC_021508	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	512443505
51	NC_021508	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443505
52	NC_021508	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	512443505
53	NC_021508	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
54	NC_021508	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443505
55	NC_021508	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	512443505
56	NC_021508	A	7	7	2182	2188	100 %	0 %	0 %	0 %	512443505
57	NC_021508	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443505
58	NC_021508	T	8	8	2313	2320	0 %	100 %	0 %	0 %	512443505
59	NC_021508	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443505
60	NC_021508	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443505
61	NC_021508	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443505
62	NC_021508	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443505
63	NC_021508	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443505
64	NC_021508	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443505
65	NC_021508	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
66	NC_021508	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	512443505
67	NC_021508	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
68	NC_021508	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443505
69	NC_021508	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443505
70	NC_021508	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	512443506
71	NC_021508	T	8	8	2837	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	512443506
72	NC_021508	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443506
73	NC_021508	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	512443506
74	NC_021508	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	512443506
75	NC_021508	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	512443506
76	NC_021508	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	512443506
77	NC_021508	A	7	7	3072	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	512443506
78	NC_021508	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443506
79	NC_021508	T	6	6	3109	3114	0 %	100 %	0 %	0 %	512443506
80	NC_021508	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443506
81	NC_021508	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	512443506
82	NC_021508	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	512443506
83	NC_021508	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443506
84	NC_021508	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443506
85	NC_021508	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443506
86	NC_021508	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	512443506
87	NC_021508	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443506
88	NC_021508	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443506
89	NC_021508	A	6	6	3788	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	512443506
90	NC_021508	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443506
91	NC_021508	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	512443507
92	NC_021508	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	512443507
93	NC_021508	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	512443507
94	NC_021508	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443507
95	NC_021508	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	512443507
96	NC_021508	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443507
97	NC_021508	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443507
98	NC_021508	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021508	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_021508	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443508
101	NC_021508	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443508
102	NC_021508	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	512443508
103	NC_021508	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	512443508
104	NC_021508	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	512443508
105	NC_021508	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	512443508
106	NC_021508	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443508
107	NC_021508	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443508
108	NC_021508	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443508
109	NC_021508	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
110	NC_021508	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443508
111	NC_021508	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443508
112	NC_021508	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443508
113	NC_021508	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	512443508
114	NC_021508	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443508
115	NC_021508	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	512443508
116	NC_021508	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	512443508
117	NC_021508	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443508
118	NC_021508	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443508
119	NC_021508	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	512443508
120	NC_021508	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443508
121	NC_021508	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	512443508
122	NC_021508	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443508
123	NC_021508	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443508
124	NC_021508	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443508
125	NC_021508	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443508
126	NC_021508	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
127	NC_021508	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	512443508
128	NC_021508	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	512443508
129	NC_021508	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	512443508
130	NC_021508	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443508
131	NC_021508	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443508
132	NC_021508	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	512443508
133	NC_021508	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
134	NC_021508	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
135	NC_021508	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	512443508
136	NC_021508	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443508
137	NC_021508	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443508
138	NC_021508	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	512443508
139	NC_021508	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	512443508
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174	NC_021508	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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258	NC_021508	GA	3	6	12508	12513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021508	GT	3	6	12516	12521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021508	GGT	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443511
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275	NC_021508	CA	4	8	13232	13239	50 %	0 %	0 %	50 %	512443511
276	NC_021508	GAA	2	6	13265	13270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443511
277	NC_021508	TGA	2	6	13312	13317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443511
278	NC_021508	GA	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	512443511
279	NC_021508	CGG	2	6	13438	13443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443511
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281	NC_021508	GC	3	6	13527	13532	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
282	NC_021508	CT	4	8	13576	13583	0 %	50 %	0 %	50 %	512443511
283	NC_021508	GTTT	2	8	13594	13601	0 %	75 %	25 %	0 %	512443511
284	NC_021508	TCT	2	6	13640	13645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443511
285	NC_021508	GAAG	2	8	13652	13659	50 %	0 %	50 %	0 %	512443511
286	NC_021508	ACAT	2	8	13687	13694	50 %	25 %	0 %	25 %	512443511
287	NC_021508	GTC	2	6	13765	13770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443511
288	NC_021508	TAT	2	6	13845	13850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021508	GTG	2	6	13904	13909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021508	T	7	7	13929	13935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021508	GTT	2	6	13992	13997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443512
292	NC_021508	T	6	6	13996	14001	0 %	100 %	0 %	0 %	512443512
293	NC_021508	GCT	2	6	14004	14009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443512
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298	NC_021508	GC	3	6	14263	14268	0 %	0 %	50 %	50 %	512443512
299	NC_021508	G	7	7	14287	14293	0 %	0 %	100 %	0 %	512443512
300	NC_021508	CG	3	6	14297	14302	0 %	0 %	50 %	50 %	512443512
301	NC_021508	TTTC	2	8	14320	14327	0 %	75 %	0 %	25 %	512443512
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369	NC_021508	GTTTT	2	10	18341	18350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
370	NC_021508	CGAT	2	8	18413	18420	25 %	25 %	25 %	25 %	512443514
371	NC_021508	GGA	2	6	18559	18564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443514
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374	NC_021508	AT	3	6	18646	18651	50 %	50 %	0 %	0 %	512443514
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376	NC_021508	TATG	2	8	18682	18689	25 %	50 %	25 %	0 %	512443514
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384	NC_021508	T	6	6	19228	19233	0 %	100 %	0 %	0 %	512443514
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392	NC_021508	GAA	2	6	19550	19555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443515
393	NC_021508	ATT	2	6	19584	19589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443515
394	NC_021508	GTT	2	6	19604	19609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443515
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397	NC_021508	TTGCG	2	10	19717	19726	0 %	40 %	40 %	20 %	512443515
398	NC_021508	ATG	2	6	19771	19776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443515
399	NC_021508	GTTA	2	8	19787	19794	25 %	50 %	25 %	0 %	512443515
400	NC_021508	A	6	6	19884	19889	100 %	0 %	0 %	0 %	512443515
401	NC_021508	CG	3	6	19907	19912	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
402	NC_021508	AGG	2	6	19933	19938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443515
403	NC_021508	TTG	2	6	19951	19956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443515
404	NC_021508	T	7	7	19980	19986	0 %	100 %	0 %	0 %	512443515
405	NC_021508	AGA	2	6	19996	20001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443515
406	NC_021508	ATG	2	6	20122	20127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443515
407	NC_021508	GAG	2	6	20199	20204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443515
408	NC_021508	GTTTT	2	10	20296	20305	0 %	80 %	20 %	0 %	512443515
409	NC_021508	G	6	6	20317	20322	0 %	0 %	100 %	0 %	512443515
410	NC_021508	GT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	50 %	0 %	512443515
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481	NC_021508	GGC	2	6	24328	24333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_021508	CAA	3	9	24575	24583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_021508	G	6	6	24870	24875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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